本发明公开了一种高效多功能污水微生物活化菌剂及其应用。本发明是利用遗弃蛋白质及少量添加剂经过发酵、脱水、蒸发、粉碎、配料及包装等一系列生产工序，制作成粉剂产品，得到进入休眠状态的活化菌。使用本发明的菌种应用于生化系统的污泥驯化，改变了生化系统污泥的驯化方式，一般只需要按照3‑10g/m3废水的投加比例，连续投加1‑2周，生化系统的即可获得活力旺盛的、接种数量足够的微生物菌群，进一步提高了微生物菌群的成长速度，提高了生化系统对废水中有机物的降解速率及效率。